Mario Martinoli è nato a Genova nel 1965. Ha intrapreso lo studio del clavicembalo all'età di quattordici anni prima come autodidatta, poi come allievo di specialisti di fama come Bob van Asperen e Kenneth Gilbert. Contemporaneamente ha studiato pianoforte sotto la guida di Martha del Vecchio. Per diversi anni, e fino al 1991, è stato maestro assistente di basso continuo presso i corsi di Musica Antica dell'Accademia Musicale Chigiana di Siena. Nel corso degli anni Novanta ha inoltre lavorato come produttore e direttore di registrazione per numerose case discografiche italiane e straniere. Negli stessi anni ha svolto attività concertistica in Italia e all'estero con numerosi ensemble da camera e orchestre, effettuando anche registrazioni che hanno formato, nel corso del tempo, una vasta discografia dedicata prevalentemente al repertorio barocco. Attivo anche come compositore di musica per il pianoforte, da qualche anno si dedica quasi esclusivamente all'attività solistica e allo studio e la riscoperta del repertorio classico e pre-classico per strumenti a tastiera, come testimoniano le sue incisioni dedicate ad autori come Schobert, Mozart, Kraus e Marchand. Ha ideato e fondato il "Premio Bonporti" di Rovereto, di cui è stato direttore artistico dal 1996 al 2005.